中國(guó)熱科院發(fā)布芒果精細(xì)基因組圖譜
近日,中國(guó)熱科院品資所聯(lián)合中科院微生物所等10家單位,繪制了芒果染色體級(jí)別精細(xì)基因組圖譜,并從基因組水平上揭示了芒果物種進(jìn)化機(jī)制和栽培品種馴化歷史。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在基因組領(lǐng)域國(guó)際頂級(jí)雜志《GenomeBiology》上。
芒果是漆樹科芒果屬熱帶常綠大喬木,是世界第五大果樹作物,也是第二大熱帶果樹作物。芒果種質(zhì)資源豐富,但現(xiàn)代育種實(shí)踐中對(duì)芒果資源的利用極為有限,長(zhǎng)期以來,芒果育種主要依賴實(shí)生選種、雜交育種等方式,其育種周期長(zhǎng)、限制因素較多。芒果基因組的解析,將為芒果種質(zhì)資源研究及其分子設(shè)計(jì)育種打開全新窗口。中國(guó)熱科院于2014年啟動(dòng)了芒果基因組解析研究,經(jīng)過多年的努力,取得了重大突破。
研究團(tuán)隊(duì)通過對(duì)傳統(tǒng)芒果品種阿方索進(jìn)行深度測(cè)序和組裝,得到了芒果精細(xì)基因組圖譜。對(duì)組裝和注釋結(jié)果進(jìn)行分析,結(jié)果表明,芒果祖先于3300萬年前附近發(fā)生了全基因組復(fù)制事件,而復(fù)制后的雙拷貝基因中,與能量代謝相關(guān)的基因被選擇性保留了下來,這些基因可能為該時(shí)期芒果應(yīng)對(duì)大氣二氧化碳濃度急劇降低和全球氣候變冷提供了適應(yīng)性優(yōu)勢(shì)。
同時(shí),研究團(tuán)隊(duì)在眾多擴(kuò)張的基因家族中,發(fā)現(xiàn)一個(gè)名為CHS的家族可能與漆酚合成相關(guān)。漆酚是芒果等漆樹科物種中特有物質(zhì),該物質(zhì)能引起人體強(qiáng)烈的致敏反應(yīng)。該發(fā)現(xiàn)將為闡明漆酚合成的分子機(jī)制提供基礎(chǔ)。該項(xiàng)目還對(duì)48個(gè)芒果品種和4個(gè)同為芒果屬的近緣物種進(jìn)行了重測(cè)序。
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